排卵が起こらないと言う事は卵子ができない訳ですから、当然、不妊症になります。排卵しにくい人、遅れる人（多くの女性は月に一度排卵があります。つまり、年に約１２回排卵があり受精・妊娠のチャンスがあります）はそれだけ受精・妊娠のチャンスが少なくなるので当然妊娠はしにくくなります。また、排卵には多くの内分泌（ホルモン）因子が関わっていますので、それらのバランスが狂うと不妊症になります。

卵管は受精の場ですから、両側の卵管の通過性がないと受精出来ません。片方の卵管が詰っている人や手術で切除している人は通過性のない卵管側の卵巣から排卵した時は受精出来ませんので妊娠のチャンスが少なくなります。卵管は卵子や受精卵を運ぶ重要な役割があるので、通過性があっても、その卵管の機能が傷害されている場合は不妊症になる可能性があります。

着床のメカニズムは未だほとんど解明されていません。ただ、子宮の内膜が異常に増殖したような場合や炎症で子宮の内腔に癒着が有る場合は着床の妨げになり不妊症になります。子宮奇形と言って、生まれつき子宮の形に異常が場合がありますが、これに関しては多くの場合着床の妨げになると考えられません。子宮筋腫や子宮腺筋症（子宮内膜症の一種）では着床障害が起こる場合があります。

膣内に射精された精子は頚管粘液の中を移動して膣内から子宮へと入っていきます頚管粘液の分泌が悪いと膣内から子宮への第一関門を通過出来る精子が減る事になるので妊娠し難くなります。また、一部に頚管粘液は分泌されていても何らかの原因で通過し難くなる場合があります。

女性のなかには血液中に精子に対する抗体ができる場合があります。（抗体とは異物が体内に入ってきた時にその異物を排除するために作られる物で生体の防御機構のひとつです）その抗体が頚管粘液の中などに分泌されますと、受精の妨げになる場合があります。現在不妊症の原因となる抗精子抗体には精子不動化抗体と精子凝集抗体があると言われています。なかでも精子不動化抗体が陽性の患者さんは大変難治性の不妊症になる場合があります。